Producteurs — plantes à fleurs aquatiques, algues (microscopiques comme les diatomées), matière organique morte (feuilles, branches, animaux).
Consommateurs primaires — racleurs (se fixent aux supports et raclent les biofilms algaux) et filtreurs (filtrent l'eau pour capturer les particules en suspension).
Décomposeurs — se nourrissent de matière organique morte.
Prédateurs — se nourrissent d'autres organismes.
Gastéropodes — Ancylus (ancyle) : forme hydrodynamique, plaqué aux cailloux, racleur, adapté au courant. Limnea : respiration pulmonaire, doit remonter à la surface, donc vit dans des eaux calmes (mares) ou des zones peu courantes.
Éphémères (larves) — ex. Baetis, Heptageniidae (3 cerques, branchies latérales ou dorsales). L'adulte vit très peu (quelques heures à 3 jours) pour se reproduire ; la larve aquatique peut vivre plusieurs mois à 2 ans. Certains ont des branchies dorsales, ce qui leur permet de s'enfouir dans la vase tout en respirant.
Coléoptères (larves) — première paire d'ailes en bouclier (élytre) ; certains sont aquatiques adultes ou larves.
Diptères (larves) — n'ont que 2 ailes (les altères sont les vestiges de la seconde paire). Simulie : petite larve (3-4 mm) qui se fixe par des crochets et déploie un filet pour filtrer l'eau. Chironomes : larves de moustiques.
Trichoptères (larves) — ailes très poilues (« tricot »). Certains tissent des filets de soie pour filtrer l'eau (ex. Hydropsyche) ; d'autres construisent des fourreaux avec des matériaux du milieu (sable, bois) pour la protection et le lest, avec un trou à l'arrière pour la circulation de l'eau (respiration). Identification : tête et 3 plaques thoraciques durcies et brillantes.
Plécoptères (larves) — deux cerques à l'arrière, souvent sans branchies visibles (respiration cutanée). Très sensibles au manque d'oxygène et à la pollution.
Hétéroptères (larves) — respiration par la peau, sensibles à l'oxygène.
Odonates (larves) — libellules et demoiselles : prédateurs, les plus grandes larves (jusqu'à 3 cm). Branchies rectales chez la libellule ; possèdent un « masque » (pièce buccale protractile) pour attraper des proies.
Crustacés — gammares (aplatis latéralement, ressemblent à des crevettes) ; aselles (aplatis dorso-ventralement).
Vers — oligochètes (annélides, présence de poils) ; hirudinées / sangsues (sans poils, ventouse arrière, lucifuges — fuient la lumière).
Poissons (indicateurs) — le chabot (max 12 cm) est un bon indicateur de rivière saine : il n'a pas de vessie natatoire, reste au fond et est très cryptique. La sensibilité au pH et à la température varie selon les espèces (gamme de tolérance écologique).
Branchiale — échange gazeux via des branchies.
Pulmonaire — respiration aérienne, nécessite de remonter à la surface.
Cutanée — diffusion de l'oxygène à travers la peau ; moins efficace, nécessite un milieu très oxygéné (espèces très sensibles à la pollution organique).
Trachéenne — via des tubes ou des pores.
Mécanisme — la matière organique non traitée est décomposée par des bactéries, qui se reproduisent de façon exponentielle et consomment énormément d'oxygène.
Conséquence — baisse de l'oxygène dissous, ce qui prive d'oxygène les espèces les plus sensibles (notamment celles à respiration cutanée).